Les volumes intérieurs se découvrent dès l'extérieur, par de larges baies vitrées surplombant l'atrium, voulues comme les cases qui remplissent les planches de BD. Sur la ville encore nouvelle de Louvain-la-Neuve, Christian de Portzamparc a fait le choix d'éloigner quelque peu le musée de la ville, pour l'intégrer à une forêt primitive, à l'image d'un "paquebot échoué". Le navire ne sombrera pas, avec les tripodes en acier qui le soutiennent et les passerelles permettant d'y accéder, par la ville ou par le bois.

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