C'est l'atelier d'architecture guadeloupéen BMC qui a été désigné mandataire, à l'issue du concours qui a eu lieu en 2007 et rassemblait près de 30 candidatures. Outre Pascal Berthelot et Jean-Michel Mocka-Celestine, le groupement comprend également Fabien Dore et Michael Marton de l'atelier Dore-Marton. L'imposant bâtiment, de 4.350 m², se résume en une phrase : "Des racines argentées sur une boîte noire". Cette boîte de granit sombre abrite l'exposition permanente et représente le socle renfermant la richesse constituée par la connaissance du passé, sur lequel se construit l'histoire collective. La couleur noire se veut un hommage aux victimes de la traite et de l'esclavage. "Le matériau utilisé présente la particularité d'être incrusté de nombreux éclats de quartz doré", le scintillement obtenu symbolisant "une constellation représentant les millions d'âmes disparues", détaille la note architecturale.

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