D'ici là, les lyonnais devront faire preuve de patience au volant car la fermeture du tunnel de la Croix-Rousse engendrera inévitablement des difficultés de circulation dans le secteur Vaise et Val de Saône. Une démarche de coordination a donc été mise en place par le Grand Lyon afin d'informer les usagers et d'instaurer des mesures d'accompagnement. Parmi les moyens déployés, on note la création d'itinéraires de substitution (qui empruntent notamment le tunnel de Fourvière), une baisse de 20 % des abonnements du périphérique Nord lyonnais, une reprogrammation des feux aux carrefours, un renforcement du dispositif de covoiturage, le renforcement des transports en commun et la création d'une dizaine de parkings de liaison provisoires représentant environ 1.200 places. Le service Info-trafic du Grand Lyon est également mobilisé.
- Déséquipement : démontage de tous les équipements (éclairage, signalisation) et curage du doublage de la voûte (carneaux de ventilation, faux-plafonds, carrelage). La présence de fibrociment amianté impliquera un confinement étanche des zones de démolition ;
- Etanchéité et voûte béton : pour éviter le ruissellement d'eau à l'intérieur du tube, la paroi sera recouverte d'un géotextile et d'une membrane PVC. Le revêtement béton sera réalisé sur ce complexe d'étanchéité, grâce à un coffrage géant permettant de bétonner des sections de 15 mètres sur 30 cm d'épaisseur (soit 70 m3 de béton par jour) ;
- Assainissement et multitubulaires : implantation dans l'espace technique sous la chaussée des réseaux d'assainissement et des réseaux câblés. Les canalisations passeront au centre de la chaussée tandis que les lignes basse et haute tension seront disposées de part et d'autre. Au total, plus de 400 km de câbles seront posés ;
- Glissières de sécurité et chaussées : mise en oeuvre de glissières de sécurité centrales, renforcées en sous-sol par des dalles béton. Elles présentent des éléments coulissants permettant aux usagers de passer d'une chaussée à l'autre et d'évacuer le tunnel ;
- Equipements et essais : installation et raccordement des automates nécessaires à l'exploitation de l'ouvrage (éléments d'éclairage, de ventilation, de sécurité incendie, de vidéosurveillance, etc.). Ils seront reliés au système d'information des tunnels du Grand Lyon.